FlashFXP kopiert Daten auf FTP-Server. Die Shareware greift dabei bei Bedarf auf mehrere unterschiedliche Server gleichzeitig zu. Ohne die Daten zwischenzuspeichern, kopiert FlashFXP Dateien von einem Server auf einen anderen.

FlashFXP kopiert Daten verschiedenster Art auf so genannte FTP-Server. Alternativ lädt der Anwender mit der Software Daten von Servern auf den eigenen Rechner herunter. Die Software bietet zahlreiche Funktionen, um Dateien möglichst schnell und sicher zu übertragen. So stellt man beispielsweise für bestimmte Dateien eine höhere Priorität ein, damit das Programm diese Archive bevorzugt auf den Server lädt. Transfers verschlüsselt FlashFXP unter anderem mit dem Sicherheitsprotokoll SSL. FlashFXP unterscheidet sich von vielen Konkurrenzprogrammen durch eine besondere Funktion: Auf Wunsch verschiebt das Programm die Daten direkt zwischen zwei FTP-Servern, ohne den Umweg über den eigenen Rechner zu nehmen.